企業申報未分配盈餘減項時要留意，包括註銷庫藏股損失、未按持股比例認購新股導致投資淨值減少等情形，在沖抵保留盈餘時必須依循一定順序，依序為同種類交易資本公積、86年度前盈餘、87年後各年盈餘，都無可沖抵時，才能沖抵上年度及當年度盈餘。
財政部中區國稅局表示，相關規定財政部早在2010年就發布過解釋令，不過仍有不少企業在申報未分配盈餘的時候，會不慎錯列減項，導致面臨補稅問題，提醒營利事業留意。
中區國稅局舉例，轄區內甲公司在107年度未分配盈餘申報案中，列報了減項約5,000萬元，並主張是因為被投資公司乙公司增資發行新股，但甲公司並未依據持股比例認購新股，導致持股比例降低，投資股權淨值減少了5,000萬元，於是直接列在當年度的未分配盈餘減項。
不過國稅局表示，這種未按持股比例認購新股的情況，應依規定順序來沖抵。經查核，甲公司同種類交易的資本公積已無可沖抵，但87年度至106年度的保留盈餘仍有近1億元，依規定應優先沖抵，不能直接列在107年度未分配盈餘的減項，最後被國稅局補稅250萬元。
國稅局官員表示，公司從事某些股權交易事項，依據國際會計準則或企業會計準則公報相關規定處理，而需要沖抵保留盈餘時，應依規定順序來沖抵，常見的情況包括前述未按持股比例認購新股，或是註銷庫藏股損失等。
再另舉一個例子來看，丙公司為丁公司的母公司，為簡化股權結構，兩公司在108年度合併，留下丙公司，丙公司取得丁公司原持股並轉為庫藏庫後，在同年度註銷，產生1,600萬元損失。
丙公司帳上有同種類庫藏股交易資本公積200萬元、86年度前保留盈餘400萬元，87年度到106年度保留盈餘為0元，在這些項目都優先沖抵後尚有1,000萬元，可分別用來計算107年度、108年度的未分配盈餘減項。
國稅局提醒，若年度間有發生特別會計事項時，應留意相關法令，依據可沖抵順序來列報未分配盈餘減項，以免產生補稅問題。
