財政部今年1月5日修正「財政部認定會計紀錄完備正確的醫院審核要點」，縮短核實認定年度，由原本提出申請年度前三年度，均依法按帳簿憑證資料辦理所得稅結算申報，且三年度均須經稽徵機關查帳核實認定，縮短為其中至少一年度經稽徵機關查帳核實認定。
另外，財政部同時放寬短漏報收入認定標準，將原無涉有短漏報收入占全年度總收入0.5％以上，或短漏報收入新台幣40萬元以上，修正放寬為無涉有短漏報收入占全年度總收入比率超過5％，或短漏報收入超過50萬元。
以台北國稅局轄區內而言，據統計，非健保醫療機構約有700多間；其中，符合前三年有設帳者大概有100家。官員表示，原則上這100家醫療機構若無涉及短漏報收入，就有資格遞交申請，如經核定，民眾至該院所就醫費用，明年申報綜所稅時就可以申請扣抵。
台北國稅局指出，財政部放寬審核要點的適用條件後，為維護病患權益，希望符合條件的非健保特約醫院、診所可儘速向所在地稽徵機關提出申請，以利民眾醫療費用支出可申報綜所稅列舉扣除額。
國稅局說明，民眾申報綜合所得稅時，會列舉扣除醫藥及生育費來節稅，但醫藥費必須是付給公立醫院、全民健康保險特約醫院及診所，或是經財政部認定的「會計紀錄完備正確」醫院，才可以列舉扣除；且有保險給付的部分不能抵稅。
若是就診處所為非健保特約私立醫療機構、也沒有申請成為財政部認定「會計紀錄完備正確」的醫院，民眾就算有醫療性質的收據在手，仍無法列報抵稅。
