財政部中區國稅局員林稽徵所表示，企業支付員工薪資除了基本薪資或底薪外，往往會有額外給予各種獎金、津貼或補助來獎酬員工及留住人才。常因誤判給付事實或不諳稅法規定，致未依薪資所得扣繳規定辦理，除遭稽徵機關限期責令補繳稅款及補報外，還要受處罰。
該所說明，近來分析課稅資料，發現某企業部分員工個人年薪近200萬元，但卻無扣繳稅額，查獲扣繳義務人甲君除按月給付員工薪水外，每月於受薪日尚額外給付職務獎金、績效獎金、全勤獎金等薪資所得，未依薪資所得扣繳辦法扣取稅款；另每月固定給付之交通津貼及超時津貼，誤歸類為「差旅費」及「加班費」而未計入薪資所得總額計算申報，致未依規定扣繳稅款。因此，扣繳義務人經稅捐稽徵機關責令補繳扣繳稅額2萬5千餘元，並依所得稅法第114條應扣繳未扣繳之規定處以罰鍰12萬餘元。
該所進一步說明，依所得稅法第14條第1項第3類規定，薪資所得為在職務上或工作上取得之各種收入，包含薪金、俸給、工資、津貼、歲費、獎金、紅利及各種補助費；而為雇主目的執行職務而支領之差旅費、日支費及加班費必須符合規定標準者才可以免稅。企業體恤員工額外給付之各種補助、補貼、津貼等，如非依出勤紀錄而是採固定金額發放者，均屬所得稅法明定之薪資所得，不得免稅。
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