跨國企業集團內部交易，特別容易被國稅局盯上，安永聯合會計師事務所建議，若要避免日後追稅風險，建議採取預先訂價協議（APA），事前解決潛在的跨國移轉訂價風險。
對於跨國企業集團而言，成本的計算可說是牽一髮動全身，安永國際及併購重組稅務會計師林宜賢指出，一般來說，在沒有簽訂APA的情況下，如果跨國企業遭到不同國家重複課稅，只能事後啟動救濟程序，這樣對貿易成本的不確定性很高，何況救濟程序還需要雙邊簽有租稅協定。
所謂的APA，是由跨國企業與國稅局，事先針對交易結果、交易條件、訂價原則、計算方法、適用期間等交易面向達成協議。安永移轉訂價服務執行總監林志仁表示，在台灣申請APA，首先要注意交易金額門檻，協議各年度的交易總額須達新台幣5億元，或單一年度交易總額達新台幣2億元。
林志仁指出，協議的基本款是單邊預先訂價協議（UAPA），其好處在於簽訂之後三至五年內，不必額外編製移轉訂價報告，僅須提交執行預先訂價協議的年度報告，譬如台商若與美國稅務機關簽訂UAPA，保留合理營業利潤，便能有效降低當地事業體的所得稅負擔。
但是跨國集團若只跟單邊稅務機關簽訂協議，還是可能被他國重複課稅，林志仁表示，如果跨國集團有其他事業體在台灣的租稅協定國，可考慮進一步申請雙邊預先訂價協議（BAPA），跟雙方稅務機關都談好，才能消除移轉訂價爭議帶來稅務風險，徹底避免雙重課稅。
然而台灣的租稅協定覆蓋範圍有限，林志仁建議，實務上台商也可考慮類雙邊APA，雖然簽不成BAPA，但集團可以同時於交易兩國，分別申請單邊APA，亦可降低重複課稅的風險。
