因應新冠肺炎疫情，今年所得稅結算申報期間首度延長一個月至6月30日，根據初步統計，2019年綜所稅申報件數共642萬件，較上年度的630萬件略增；而稅收淨額1,285億元則較上年度減少約10億元，略減0.78%。官員表示，後續還會有部分稅收入帳，綜所稅稅收與上年度大致持平。
值得注意的是，今年報稅選擇採人工申報的申報案件較上年度減少近五成，可能是因為疫情關係，民眾盡量避免群聚，多轉往網路申報或採稅額試算。據統計，今年網路申報約占總申報件數的六成三，稅額試算約占三成五，人工申報僅占1%。
營所稅方面，稅收情形較為不妙，總申報件數約96萬件，較上年度增加約2萬件，自繳稅額2,925億元，較上年度大減858億元，下降22.69%，是近三年新低，若再加上下半年營所稅暫繳恐受疫情影響，今年稅收達標難度高。
財政部分析，營所稅自繳稅額之所以大減有兩大原因，第一是上市櫃公司去年獲利較上年度衰退。
第二則是許多企業減稅措施今年報稅首度適用，例如產創條例智慧機械投抵，未分配盈餘加徵營所稅也有不少減稅措施，包括稅率降為5%、產創條例未分配盈餘實質投資可列減項，以及因應疫情，今年首季虧損可抵未分配盈餘稅等。
根據統計，今年未分配盈餘稅自繳稅額，較上年度大減近六成；另因租稅優惠因素，今年最低稅負自繳稅額也大減五成左右。
財政部指出，今年所得稅預算目標為1.1兆元，其中營所稅預算數為6,397億元，綜所稅為4,722億元，目前看來要達標恐有難度。此外接下來9月還有營所稅暫繳，可能會受到疫情衝擊而導致稅收減少，後續仍須持續觀察稅收入帳情形。
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