財政部南區國稅局指出，企業要適用虧損扣除制度必須符合四項條件，包括營利事業為公司或有限合夥組織、會計帳冊簿據完備、虧損及申報扣除年度均使用藍色申報書（或經會計師查核簽證）、如期申報等。
近兩年全球受疫情影響，各國內需企業深受重創，營運舉步維艱，營收也呈現赤字虧損。官員表示，部分企業在2020年受疫情衝擊，2021年因應數位轉型腳步，可能有小幅獲利，我國預期不少企業可能會在2022年五月報稅季適用虧損扣除。
官員指出，過去企業申報虧損扣除最常犯三大錯誤，其中最多的是計算虧損額度錯誤，還有會計帳冊不完備、未如期申報等。企業計算錯誤多為計算虧損額度時，未計入投資台企獲配股利收入情況。
依所得稅法第39條、42條等規定，當年度企業虧損須減除「不計入所得額的各項收益」，若有餘額，才能做為虧損扣除額度以在後續年度抵稅。
舉例來說，A公司在2020年因疫情虧損300萬元，但投資國內企業獲配股利收入100萬元；另A在2021年因轉型電商有成，全年所得額約800萬元。
A在2022年五月報稅時，以近兩年度藍色申報書或簽證、帳冊等資料申請盈虧互抵，申報2020年度虧損扣除額為200萬元（300萬元-100萬元），扣除後2021年度課稅所得額為600萬元（800萬元-200萬元），以營所稅率20％計稅則為120萬元。
官員也表示，公司盈虧必須要證明為真實情況，因此需採納藍色申報書或簽證以茲證明。
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