隨房地合一2.0自2021年7月上路，企業出售2016年後取得不動產皆適用房地合一2.0，最高適用45％重稅。但高雄國稅局表示，若企業享有各類投資抵減型的租稅優惠如研發支出投抵，可用於抵減房地合一稅負，有效降低短期交易課重稅負擔。
我國房地合一2.0增加課稅標的，包括2016年後取得的預售屋及其坐落基地，同時也將企業法人列入差別稅率課稅範圍，若企業出售持有兩年內不動產則適用45％稅率、兩年到五年內為35％、五年以上皆為20％，採分開計稅，每年申報營所稅時合併報繳。
依現行所得稅法第24-5條規定，企業房地合一2.0所得額與稅額，皆與營利事業其他所得分開計算抵減，另可按實際成交價額3％計算必要費用（預售屋則為轉賣價格），以30萬元為限。
但官員指出，企業房地合一稅性質仍屬於當年度營所稅，可一併適用研發支出、5G與智慧機械、生技研發等投抵優惠，惟單項抵減上限為30％營所稅額，企業當年度合計抵減總額不能超過50％營所稅額。
若今年報稅要適用投抵優惠，官員指出，企業必須在今年2～5月底前先向經濟部工業局等主管機關申請通過後，後續才能向國稅局列報抵減。
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