針對多角化經營的中大型的醫療診所，不同銷售項目的稅務規定有別，高雄國稅局指出，首先，若是提供專業服務的銷售項目，可免納營業稅；但如果另有銷售實體商品、與醫療業務範圍無關的課程，不僅須設立稅籍，甚至還可能有申報的義務。官員指出，醫療院所的型態很多，特別是診所類的經營模式，收入來源大多屬於醫師的執行業務所得，依據《加值型及非加值型營業稅法》第3條及施行細則規定，執行業務在提供其專業性勞務時，只要歸課執行業務所得就好，不屬於營業稅課稅範圍。
不過回到稽徵實務面，官員指出，特別像是眼科、皮膚科、醫美，還包括動物醫院等，類似的專科診所當中，常常會額外經營相關領域產品的銷售，這方面可就不在營業稅排除的範圍中。
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官員指出，譬如皮膚科診所，可能還會兼營保養品銷售；而坊間不少的牙醫診所，也會兼賣牙膏、牙刷等相關產品，此類有關貨品的銷售行為，還是要受到營業稅法規範，只要有銷售行為，就要設立稅籍、課徵營業稅。
甚至不只是貨品銷售，官員表示，坊間動物醫院也不只賣寵物用品，還會提供寵物美容、寵物旅社等服務，醫美相關產品，也會有搭配的課程，這些銷售「勞務」的行為，同樣受到營業稅法的規範。
官員表示，特別針對多角化經營的中、大型診所，若有銷售應稅範圍的貨物或勞務，便要設立稅籍，國稅局會依照營業規模判斷，其銷售行為要歸類為查定課稅的小規模營業人，或是核定為使用發票營業人，每期由業者主動報繳營業稅。
如果診所僅銷售少量業務相關商品，官員表示，那麼核定為小規模營業人的機會就很大，相關的營業稅負擔也較輕，但提醒業者，還是會有主動設立稅籍的義務。
