跨國企業外派台幹時，薪資、差旅費等常由國內總公司支付，但要留意在海外設立的據點性質，南區國稅局表示，外派至海外子公司的情況，費用就該由子公司自行負擔，總公司錯誤列報，將遭剔除補稅。

官員表示，國內有位台商經營跨國業務、深耕新南向國家，而總公司則設於南區國稅局轄下，先前查核2018年度營所稅申報案時發現，這間公司當年列報的旅費高達350萬元，細看才發現其中有200萬元，是該公司支付派駐張姓台幹，到印尼子公司擔任總經理的差旅費。

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官員表示，印尼子公司雖然確實是由台灣總公司投資設立，但對國稅局而言，那間子公司已經是當地的獨立法人，財務與會計都是獨立的，因此張姓總經理派駐期間的相關差旅費或薪資費用，都應該要由印尼子公司負擔，與台灣總公司營業無關。國稅局最後也剔除差旅費用，要求總公司補稅。

官員表示，按《所得稅法》規定，要認列營業費用，重點不僅有實際支付，還須檢視費用支出與營業活動的關聯性，如果不是公司經營本業及附屬業務的費用，就與營業活動無關，依收入與成本費用配合原則，不得認列。

隨著經濟全球化，營利事業在國外設立子公司的情形日益增多，常常發現國內母公司列報旅費，卻是屬於國外子公司應付費用，這些常常都是不合格的，會被剔除補稅。

官員表示，此類案件重點也在於，海外子公司是獨立的法人，如果台商在海外設立的是分公司，最後營收都會歸到總公司帳下，因此由台灣總公司列報差旅費、薪資費用等，才會合理。

官員提醒，企業在列報旅費支出時，提示出差報告單以及相關文件時，必須詳載逐日出差地點、訪洽對象及工作內容等，向國稅局證明這趟行程與營業實際相關，供國稅局認定節稅。又如同印尼台幹這個案例，出差報告單僅註明派駐天數及職位，即便是合理派駐分公司，也可能因過於簡陋而遭剔除。