申報盈虧互抵的企業，要留意「如期申報」這項要件，台北國稅局表示，即便如期申報營所稅，但如果逾期才完成繳款，但仍屬於逾期申報，當年度恐怕無法適用盈虧互抵。
官員表示，有個纏訟多年的稅務核定案件，最近才經法院判決落幕，某公司在申報2016年度所得時，壓線在當時申報期最後一天（5月31日）才完成申報，且列報核定虧損2億餘元主張盈虧互抵。
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看起來雖然像是如期申報，然而該公司因為作業較慢，直到6月2日才完成稅款繳納，官員表示，就因為晚了二天繳稅，因此國稅局認寪，此案不符合盈虧互抵的「如期申報」要件，因此不讓該公司認列那2億餘元虧損，此案歷經復查、訴願，國稅局與財政部立場都不變，最後在台北高等行政法院判決下，該公司的行政訴訟也敗訴。
