財政部高雄國稅局表示，財政部於112年9月15日以台財稅字第11200604860號令釋，機關(構)、事業單位、學校、法人、團體(以下統稱雇主)給付員工確診嚴重特殊傳染性肺炎（下稱COVID-19）隔離治療（包括居家照護、收治於指定處所或醫院）請假期間之薪資超過勞動基準法(下稱勞基法)工資給付標準或勞雇雙方約定金額，於該解釋令發布時尚未核課確定者，得於112年12月31日以前依廢止前嚴重特殊傳染性肺炎防治及紓困振興特別條例（下稱紓困條例）第4條第1項規定，就該超過部分金額之200%，申請自申報當年度所得稅之所得額中減除。

該局說明，倘員工確診COVID-19，且經衛生主管機關通知居家照護、收治於指定處所或醫院之隔離治療，係確診員工配合中央流行疫情指揮中心指揮官所為應變處置指示，依照指揮中心、衛生福利部及勞動部相關法令規定，請「普通傷病假」、「特別休假」或「事假」；另依據「勞基法」第38條及39條，以及「勞工請假規則」第4條第3項及第7條規定，「特別休假」雇主應給付原定工資100%、「普通傷病假」雇主應給付原定工資50%、「事假」不給工資；爰此，基於隔離治療係配合防疫政策需要，如雇主給付確診員工隔離治療請假期間之薪資超過規定標準或勞雇約定部分，得適用薪資費用加倍減除。

該局進一步舉例說明，適用勞基法之A公司員工甲君，其日薪為新臺幣(下同)2,000元，倘甲君於111年間確診COVID-19，分別請「特別休假」、「普通傷病假」及「事假」各3日(皆發生於111年度)，雇主A公司給付甲君隔離治療請假期間之薪資18,000元(包括「特別休假」期間薪資10,000元、「普通傷病假」期間薪資6,000元，及「事假」期間薪資2,000元)，則其可適用加倍減除之申請金額分別為「特別休假」4,000元[即10,000元-(2,000元×3日)]、「普通傷病假」3,000元[即6,000元-(2,000元 × 50% × 3日)]及「事假」2,000元[即2,000元-(2,000元×0×3日)]，如A公司111年度營利事業所得稅結算申報案尚未核課確定，可依限檢具規定文件，申請適用薪資費用加倍減除金額計9,000元。

該局提醒，雇主給付確診員工上開薪資支出所屬年度已辦理所得稅結算、決算或清算申報案件，於上開解釋令發布(112年9月15日)時尚未核課確定者，得於112年12月31日以前，按規定格式填報，並檢附薪資金額證明、計算明細表及請假相關證明文件(如各級衛生主管機關開立之COVID-19指定處所隔離通知書或隔離治療通知書、請假單或其他證明文件)，申請適用薪資費用加倍減除；逾期申請者，不予受理。另未屆申報期限之案件(以曆年制為例、即確診員工因確診請假時間落於112年1月1日至同年6月30日間)，則於辦理該年度所得稅結算、決算或清算申報時，依式填報並檢附相關文件申請適用。

另為便利民眾瞭解財政部因應疫情之相關稅務規定及申請流程，財政部網站已建置「財政部因應嚴重特殊傳染性肺炎專區」(https://www.mof.gov.tw/covid19)提供即時多元資訊，請多加利用。如有疑義，可撥打免費服務電話0800-000-321洽詢，或至本局網站(https://www.ntbk.gov.tw)利用國稅智慧客服「國稅小幫手」線上查詢。

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