財政部指出，獨資、合夥組織自2018年度起，雖然要申報營所稅、但是免課稅，而且每年9月甚至免申報營所稅暫繳。此外，如果獨資企業主過世、由子女繼承衣缽，店內存貨、資產移轉給下一代免課營業稅。
獨資或合夥組織屬於我國《商業登記法》範圍，多半命名為「商號」、「社」、「行」、「店」、「坊」等，設置成本較便宜、頗受新創事業青睞。
官員指出，獨資、合夥組織、小規模營業人屬於個人營業性質，每年5月申報營所稅即可、部分甚至免申報，而9月營所稅暫繳一律免申報。
我國自2018年所得稅改後，一般大型的獨資、合夥組織為每月營業額超過20萬元，需開立發票適用5％營業稅率。大型的獨資、合夥組織在每年5月雖然還是要申報營所稅，但只報不繳，其收入是按出資比例，以營利收入名義歸課到企業主、合夥人的個人綜所稅，大幅簡化新創事業的報稅程序。
此外，獨資、合夥組織若每月營業額未超過20萬元則屬於小規模營業人、適用1％營業稅率且免開發票。國稅局是採取定期查核營收、再推估到全年收入。官員指出，若獨資、合夥組織屬於查定課徵營業稅的小規模營業人，可以免辦理營所稅申報，等於免報免繳營所稅，直接列為個人所得課稅。
官員指出，目前我國綜所稅率為5％～40％累進級距，乍看之下比營所稅率為20％還要高，但是獨資合夥企業每年營收多為100萬元左右，若是全數併入綜所稅，在減除各項扣除額與免稅額之後，獨資企業主適用稅率多為12％或5％，而且從實務方面來看，稅負比營所稅更輕。
此外，官員表示，若是獨資企業的負責人死亡，由繼承人繼續經營，申請變更負責人為繼承人或一併變更商號名稱時，其繼承人獲得店內剩下的存貨以及固定資產、屬於繼承情況，並不屬於營業稅法規定的銷售貨物範圍，因此可以免課營業稅。
