跨國企業申報營所稅時，須特別注意租稅協定衍生影響，台北國稅局表示，若在租稅協定國可享股利扣繳優惠，卻疏忽未申請，額外溢付的稅款，我國國稅局可不買單，查獲將剔除補稅。
官員表示，我國迄今簽有33個已生效的全面性所得稅協定，營利事業取得租稅協定國來源所得，應留意租稅協定當中，有沒有提供免稅、給予優惠稅率等規定。
台北國稅局近期查到一件2018年度的營所稅申報案，我國甲公司有轉投資印尼的乙公司，當年申報股利收入1,000萬元，其中已在印尼繳納200萬元所得稅，甲公司也主張要抵減我國營所稅。
官員表示，確實依《所得稅法》規定，台灣企業在外國繳納的所得稅，可以當地憑納稅證明，回來抵減在台灣應納的營所稅額，抵減上限依我國營所稅率計算，最高抵減20%。
但企業若是取得租稅協定國的來源所得，卻因未行使租稅協定的優惠，因而溢繳海外稅款，官員表示，依《適用所得稅協定查核準則》第36條規定，這筆溢繳的海外稅款，將不得扣抵我國應納營所稅額。
回到甲公司的例子中，官員表示，由於我國跟印尼簽有租稅協定，依據雙方租稅協定的內容，對股利課徵的稅額，不得超過股利總額的10%，換句話說，1,000萬元股利收入，其中只有100萬元須課稅。
官員表示，既然甲公司在印此，沒有針對此項股利收入，向印尼稅捐稽徵機關爭取適用租稅協定上限稅率，因而溢繳的國外稅額100萬元，便不得扣抵我國營所稅額。
最後，甲公司雖主張以印尼繳納的200萬元所得稅，抵減我國營所稅額，但國稅局依法只讓甲公司抵減100萬元營所稅額，另核定補繳稅款100萬元。
官員提醒，跨國企業要留意租稅協定相關權益，主動在他方締約國提出優惠申請，以免在當地溢繳稅款，在台又不得扣抵我國應納稅額，導致重複課稅。
