文教及公益慈善團體報稅時應注意，台北國稅局指出，如果年度間曾獲配股利或盈餘收入，卻漏未申報當年度營所稅，短漏金額達一定程度以上，將會喪失組織原有的租稅優惠。
官員表示，以往教育、文化、公益、慈善機關或團體獲配國內股利或盈餘，相關收入是不計入所得額課稅的，例如坊間不少企業曾成立基金會並持股，基金會就可能適用當時的規定。
然而《所得稅法》第42條已經在2018年2月7日修正，刪除對機關團體的適用文字，並追溯至當年1月1日起施行，官員表示，現在公益團體獲配國內股利或盈餘，已經失去過去的免稅資格，而必須列為收入申報。
官員表示，雖然股利必須申報為所得額，不過根據規定，符合標準的公益團體，多數的收入還是可以免納所得稅，包括股利收入在內，還有像是利息收入、捐贈收入等，原則上若有如實申報、短漏報情形輕微，都還是可以免稅，只有銷售貨物、勞務的所得應課稅。
