因應兩岸特殊關係，北區國稅局表示，營利事業若有中國大陸來源所得，跟海外所得不同，相關憑證至今仍須取得海基會的認證，才能抵減在台的營所稅額。
營利事業申報海外所得時，可以拿當地的納稅證明回台抵稅，官員表示，目前針對大陸來源所得、他國來源所得，都適用前述的規定，抵減模式相同，但是法源依據卻不同。
推薦
正因為法源適用不同，目前申報方式也有一點差異，官員表示，以往台商集團從各國取得納稅證明後，還要透過我國在當地的駐外單位驗證，才能在台抵稅，不過自2017年度，財政部簡化作業流程，多數跨國企業可以直接拿當地的納稅證明，回來台灣抵減營所稅了。
但對大陸的規定卻不一樣，官員指出，雖然對各國都已簡化流程了，但台商企業若有大陸所得，仍須找海基會做認證，在台灣才能享有抵稅的功能。官員提醒，抵減大陸已納稅額時，也要注意應以當地納稅日的匯率換算為新台幣來抵減我國營所稅，以及抵減額度上限。
