建商、券商及期貨商等三大買賣業，申報營所稅時，在成本費用的計算上要特別小心，北區國稅局指出，這三類買賣業的主業都涉及免稅收入，相對應的成本費用不能主張節稅，而年度的行政支出，也只能依應稅收入占比來節稅。
官員表示，包括土地交易所得、證交所得及期交所得，《所得稅法》當中訂有許多免稅的項目，這些所得項目既不課稅，相關支出就沒必要、也不能主張節稅。
對於一般企業而言，單筆買賣的收入，很容易就能區分清楚相對的所得及必要成本，但是對於建商、券商及期貨商等三大買賣業而言，這三類業者主要經營的類別就是免稅項目，實務上他們的所得性質，很可能同時涵蓋應稅所得及免稅所得，稅務就有不少眉角要處理。
舉例來說，建商出售成屋時，房屋的部分歸為應稅所得，土地部分可能歸為免稅所得，也可能因房地合一稅的關係，二者都是應稅所得；有價證券交易所得雖然免稅，但是券商向客戶收取手續費，則屬於應稅所得。
官員表示，有些成本費用可以明確的歸類，像是原先購地的成本，當然屬土地交易所得的必要支出，這方面所得不課稅、成本也不能抵減；但像是建商辦公室租金、年度人事行政支出等營運費用，就很難明確歸類到應稅所得或免稅所得項下。
像這種不能歸類的支出，官員表示，業者要自行計算當年度應稅收入淨額、免稅收入淨額的占比，例如建商若有三成收入屬免稅收入，七成收入為應稅收入，行政支出等營業費用，就可以拆分出七成可以認列抵減所得、三成不能抵減。
官員表示，由於經營項目特殊，建商、券商及期貨商等三類業者，都適用這種成本費用計算方式。
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