去年新冠疫情造成民眾無法自由進出國門，有國人因此滯留國外無法返國，也有外籍人士無法出境或留在台灣避疫，造成稅務身分改變，居住者與非居住者身分調換，恐導致稅負加重。財政部賦稅署發函全台五區國稅局，要求若遇到類似案件要透過個案審核方式，以對納稅人有利的方式處理。
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財稅官員表示，稅法規定，只要在國內有住所（有戶籍）或住滿一八三天，就屬我國稅務居民（居住者），五月要申報綜所稅，稅率最高百分之四十；在台居留超過九○天的非稅務居民（非居住者）則所得要「就源扣繳」，扣繳率最高百分之廿一。
台北市國稅局官員舉例，有位陸籍主管去年春節回陸過年後就因疫情無法返台，非居住者薪資所得須就源扣繳百分之十八，居住者的薪資則五月結算申報綜所稅並有扣免額，計算之後就源扣繳相對不利，國稅局查核後同意他以居住者身分報稅。也有民眾去年出國家洽公，因疫情航班停飛無法滯留國外，導致變成非居住者，國稅局最後也同意當事人可以居住者身分報稅。
一般而言，非居住者稅負相對低，尤其是高所得者，若因疫情導致稅務身分轉變使稅負加重，當事人可主動提出申請，國稅局會依個案處理。
官員提醒，必須因為疫情等因素導致無法返國，並提出相關證明，國稅局審核通過後，才會對當事人做出比較有利的處理方式；國外有些國家同意有條件進出，這類個案就不適用從寬認定的規定。
