財政部指出，最低稅負制自2006年實施，當時針對未上市櫃股票交易所得，就明訂須納入個人基本所得額課徵基本稅額，以避免應稅的營利所得及財產交易所得轉換為免稅的證券交易所得。
不過，到了2013年，當時馬政府推動復徵證所稅，未上市櫃股票交易所得回歸所得稅法規定來課徵所得稅，因此配套修法，刪除未上市櫃股票交易所得應計入個人基本所得額課稅的規定。
然而證所稅復徵後，外界罵聲連連，券商、散戶反彈聲浪不斷，大戶持續出走，最後僅實施兩年就喊停，並自2016年元旦起停徵證所稅。不過，2013年時配套刪除的未上市櫃股票交易所得計入個人基本所得額，並未跟著證所稅停徵而同步恢復。
財政部官員表示，當年證所稅存廢問題紛紛擾擾，股市狀況也不好，後來在立法院決議下停徵證所稅，當時氛圍下，不適合同步恢復未上市櫃股票交易所得計入基本所得額，不過近年包括立法院預算中心、審計單位等，也都曾指出這項稅制問題，要求財政部檢討。
因此財政部近日預告修法，強調為落實基本所得稅額條例，建立個人所得稅負擔對國家財政基本貢獻的立法目的，應恢復將個人未上市櫃股票交易所得計入個人基本所得額課稅，因此擬具修正草案，並辦理預告程序，未來將送立法院審議，若順利完成修法，預計自2021年1月1日施行。
舉例而言，在修法前，個人股東甲君可在A公司累積盈餘1,000萬元即將分配前，將手上持有的股票賣給B公司，原本1,000萬元股利所得，採分開計稅稅率28%，應課徵280萬元所得稅，但甲君將持股賣給B公司，將股利所得轉換為1,000萬元的證券交易所得，由於現在停徵證所稅，等於1,000萬元全部免稅，省稅省很大。
不過未來修法後，甲君即使透過前述方法來移轉財產，1,000萬元證券交易所得雖不用課證所稅，但須計入基本所得額計稅，若甲君須課徵基本所得稅額，稅率為20%，此時須課徵200萬元基本稅額，省稅空間相對縮小許多。
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