企業在年度盤點存貨時，列報成本必須留意二種情況。首先在生產成本方面，年度間未使用完的原物料，應該要轉列為盤存；其次在成品方面，如果盤點到尚未出售但是已經毀損的存貨，應列為其他營業成本，錯誤列報或重複列報，都可能引發補稅危機。
官員表示，營利事業在購入間接材料或物料後，原則上尚未耗用完畢的部分，應在會計年度終止日轉列存貨，若沒轉列，就有可能導致虛增營業成本。
國稅局在查核成本時，都會去了解成品產製耗用原物料的通常水準，企業產製貨品的原料耗用數量，應根據有關帳證紀錄核實認定，也會透過同業工公會及有關機關，共同擬定各類原料的通常耗用水準。
官員表示，若有上年度理應耗盡的間接材，其實當年度結束仍留有存貨，但是業者隱匿未列帳，則當年度及隔一年度，都可能會有浮列營業成本的問題，若遭到檢舉，就會視個案而補稅、甚至祭出罰則。
賦稅署指出，依《營利事業所得稅查核準則》規定，如年度間未耗用完的文具用品，年終購入尚未耗盡的大批燃料、或是商品生產過程中，所產生的副產品、下腳及廢料等，如果尚未出售，都應該要計價列入盤存。
官員表示，還有另一種常見樣態，在於企業在年度盤點時發生存貨盤損，相關金額雖可依法列報為「其他營業成本」，但在部分案件當中，會誤將該金額重複列為當年度製成品的其他成本加項，導致營業成本計算錯誤。
針對申報不實、因而產生短漏報所得的業者，官員指出，依據短漏報的樣態，有可能會依《所得稅法》第110條規定處罰，對於有自行辦理營所稅結算申報的業者，卻核有漏報或短報所得額的情況，會處以所漏稅額二倍以下罰鍰；如果是完全未辦結算申報的業者，除依法核定補徵應納稅額外，應照補徵稅額，處三倍以下罰鍰。
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