財政部指出，企業如果運用自行研發的智財權轉讓或授權，可享有研發投抵兩倍減除優惠、且智財權入股還可享有緩課稅優惠，可以等到實際轉讓或撥轉再按照轉讓時價或取得時價擇低計稅，增加人才留任誘因。
為促進創新研發成果流通及應用，《個人公司或有限合夥事業研究發展支出適用加倍減除辦法》規定，只要企業讓與或授權自行研發所有的智慧財產權、獲得收益，可依照當年度智財權研發支出金額200％限度內減除營所稅。
不過，官員也提醒，雖然智財權研發支出可加倍抵稅，但考量到重複優惠情況，財政部也在辦法中規定，智財權投抵跟研發支出投抵只能擇一適用，不能併行適用。他建議，公司可以自行規劃，像是特定年度專門研發智財權，當年度加倍減除，而其他年度則運用研發投抵，可分年享受減稅效益。
此外，也提供智財權入股緩課優惠，如果企業、有限合夥事業將自行研發智財權授權或直接賣給其他公司、交換股份，即可選擇當年度課徵或是延後至實際轉讓或撥轉再課稅，但只要選定後則無法變更。
若為當年度課稅，則新創公司收入為取得的證券總價值；若選擇緩課，必須持有該股票兩年以上，再依照轉讓價或取得價擇低計算所得稅。
舉例來說，新創公司研發出一項智財權，受到大公司青睞，因此大公司與新創公司簽署授權合約，大公司以1千張股票（每股市價90元）購買該項智財權使用權限，等於大公司用價值9千萬元的證券買下該項智財權合法使用權。
新創公司若選擇當年度課稅，則該年必須認列9千萬元的收入，按照現行營所稅率20％計算，稅負即為1,800萬元。
若新創公司手上現金流不足，可採緩課方式，等未來賣出再來計稅，假設該公司股價後來漲到每股100元、新創公司再賣掉，證券轉讓價值等於是1億元，但新創公司可選擇取得時價或轉讓時價擇低課稅，所以還是採取得時價計稅，認列收入9千萬元、達到節稅目的。
