財政部北區國稅局表示，公司組織之營利事業如符合所得稅法第39條規定，會計帳冊簿據完備、虧損及申報扣除年度均使用藍色申報書或經會計師查核簽證、如期申報條件者，得將經稽徵機關核定之前10年內各年虧損，自本年度純益額中扣除後再行核課納稅。但核定虧損年度如有依所得稅法第42條規定不計入所得額之投資收益，應先減除各該年度之投資收益，再以其餘額，自本年度純益額中扣除。
該局舉例說明，A公司109年度營利事業所得稅申報純益600萬元，申報108年度核定虧損扣除額300萬元，二年度均符合前揭所得稅法第39條盈虧互抵之規定，108年度有所得稅法第42條規定不計入所得額之投資收益250萬元，A公司109年度申報扣除108年度虧損時，未扣除108年度依所得稅法第42條規定不計入所得額之投資收益，經重新核算，核定前10年核定虧損本年度扣除額為50萬元（300萬元-250萬元），予以補徵稅額50萬元（250萬元*20%），並依所得稅法第100條之2規定，自結算申報期限截止之次日起，至繳納補徵稅款之日止，依郵政儲金一年期定期儲金固定利率，按日加計利息，一併徵收。
該局特別提醒，公司組織之營利事業依所得稅法第39條規定申報扣除前10年核定虧損時，應留意虧損年度有無取得所得稅法第42條規定不計入所得額之投資收益，以免遭補稅及加計利息；營利事業如有不明瞭之處，可至該局網站（http://www.ntbna.gov.tw）查詢相關法令或撥打免費服務電話0800-000321洽詢，該局將竭誠提供詳細之諮詢服務。
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