境外電商課稅制度已經上路多年，中區國稅局表示，我國營利事業向境外電商採購服務時，可留意對方能否適用租稅協定優惠，提早檢附合約書、授權書等文件申請營業利潤免稅，省下事後才辦理退稅的麻煩。
目前共有33個與我簽署全面性租稅協定的國家及地區，為避免跨國重複課稅，來自這些國家及地區的境外電商，在我國境內若無常設機構，其營業利潤只要在當地課稅即可，在台灣不會課稅。
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不過這些規定不只境外電商受惠，我國營利事業與境外電商交易，通常也會擔任扣繳義務人，甚至在國際商業環境下，許多境外電商還會要求，扣繳稅款應由我方企業負擔。我國企業向境外電商採購服務時，可以多留意對方適否符合適用租稅協定的資格，若能申請營業利潤免稅，對我方而言，也可少負擔一筆稅款。
扣繳義務人申請營業利潤免稅時，首先要注意的是申請文件，官員表示，儘管是我方做扣繳、辦理申請，但國稅局課稅的主體仍是對方境外電商，申請時應檢附境外電商的委任書、租稅協定國的居住者證明、所得證明，以及雙方交易合約書影本等。
